Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNRF3Q9ULT6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms