Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms