Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDE1Q9NZC3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDE1Q9NZC3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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