Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM248Q9NWD8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM248Q9NWD8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms