Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FBXO28Q9NVF7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms