Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-5Q9HDB9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms