Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPJQ9HC77 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms