Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms