Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLSPNQ9HAW4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLSPNQ9HAW4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms