Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms