Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GABARAPL3Q9BY60 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms