Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCAPERQ9BY12 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms