Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC12A9Q9BXP2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC12A9Q9BXP2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms