Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BPIFA3Q9BQP9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPIFA3Q9BQP9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms