Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOPXQ9BPY8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms