Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms