Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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PKP4Q99569 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PKP4Q99569 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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