Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCF12Q99081 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms