Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSF3RQ99062 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms