Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LCORQ96JN0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LCORQ96JN0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LCORQ96JN0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms