Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RNFT2Q96EX2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RNFT2Q96EX2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RNFT2Q96EX2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNFT2Q96EX2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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