Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHFRQ96EP1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHFRQ96EP1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms