Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTTNBP2Q8WZ74 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms