Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC12Q8WUD4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC12Q8WUD4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms