Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF248Q8NDW4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF248Q8NDW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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