Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AVL9Q8NBF6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms