Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPAP2Q8IXW5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms