Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CMC1Q7Z7K0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms