Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ANKRD40Q6AI12 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms