Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms