Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C1orf146Q5VVC0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms