Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BRMS1LQ5PSV4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms