Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms