Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLPPQ16740 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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