Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN3Q16667 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN3Q16667 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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