Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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