Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNHIT3Q15649 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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