Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKIV2LQ15477 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKIV2LQ15477 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms