Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPRHQ149N8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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