Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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CHD4Q14839 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHD4Q14839 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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