Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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