Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SPIDRQ14159 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SPIDRQ14159 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SPIDRQ14159 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SPIDRQ14159 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SPIDRQ14159 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPIDRQ14159 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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