Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms