Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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DDX39BQ13838 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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