Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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