Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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