Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SCGB2A2Q13296 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCGB2A2Q13296 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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