Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NME3Q13232 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME3Q13232 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NME3Q13232 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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NME3Q13232 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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NME3Q13232 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NME3Q13232 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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