Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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