Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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